Schefferus was later in life involved in an intellectual dispute, particularly with Olof Verelius (1618–1682) over the location of the Temple at Uppsala.
Johannes Scheffer (latinisiert Johannes Schefferus) wurde als Sohn des wohlhabenden Kaufmanns Johann Scheffer und seiner Frau Elisabeth Kraschel geboren.
AUC Philologica (Acta Universitatis Carolinae Philologica) je akademický časopis publikující jak lingvistické, tak literárně historické a teoretické studie.