Jokohama byla vybrána jako jeden z těchto přístavů místo Kanagawy, u které se Tokugawský šógunát obával, že leží příliš blízko Tókaidó – strategické cesty spojující Edo s Nagojou, Kjótem a Ósakou.
Jokohama byla malou rybářskou vesnicí v dobách, kdy Japonsko udržovalo politiku sebeizolace. Ke konci období Edo nastal rychlý obrat, v roce 1859 byl otevřen přístav a město se tak stalo vstupní branou pro většinu zahraničního obchodu.
Jedním z olympijských měst je Jokohama – největší japonský přístav a město, které na konci války zničilo americké bombardování. A dodnes nese i zajímavé české stopy.